Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SNX21Q969T3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SNX21Q969T3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SNX21Q969T3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX21Q969T3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms