Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC38A4Q969I6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC38A4Q969I6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC38A4Q969I6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC38A4Q969I6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms