Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PEX13Q92968 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PEX13Q92968 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PEX13Q92968 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PEX13Q92968 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms