Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
P3H4Q92791 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
P3H4Q92791 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P3H4Q92791 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms