Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PROX1Q92786 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PROX1Q92786 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PROX1Q92786 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms