Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKL2Q92772 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKL2Q92772 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKL2Q92772 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms