Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF4BQ92750 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAF4BQ92750 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TAF4BQ92750 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms