Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CASKIN2Q8WXE0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASKIN2Q8WXE0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASKIN2Q8WXE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms