Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF47

ZFP90, Zinc finger protein 90 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP90Q8TF47 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZFP90Q8TF47 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZFP90Q8TF47 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZFP90Q8TF47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZFP90Q8TF47 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms