Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC41

RNF217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF217Q8TC41 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNF217Q8TC41 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF217Q8TC41 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF217Q8TC41 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms