Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSDMBQ8TAX9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GSDMBQ8TAX9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GSDMBQ8TAX9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GSDMBQ8TAX9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms