Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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