Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM71DQ8N9W8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM71DQ8N9W8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM71DQ8N9W8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms