Protein–RNA interactions for Protein: Q8N443

RIBC1, RIB43A-like with coiled-coils protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC1Q8N443 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIBC1Q8N443 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIBC1Q8N443 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIBC1Q8N443 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms