Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
VWDEQ8N2E2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
VWDEQ8N2E2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
VWDEQ8N2E2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VWDEQ8N2E2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
VWDEQ8N2E2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms