Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GDPD3Q7L5L3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GDPD3Q7L5L3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GDPD3Q7L5L3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms