Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RBM43Q6ZSC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RBM43Q6ZSC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RBM43Q6ZSC3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms