Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC73Q6ZRK6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC73Q6ZRK6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC73Q6ZRK6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC73Q6ZRK6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms