Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCNI2Q6ZMN8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNI2Q6ZMN8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNI2Q6ZMN8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNI2Q6ZMN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms