Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF544Q6NX49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF544Q6NX49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF544Q6NX49 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms