Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
REEP3Q6NUK4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REEP3Q6NUK4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REEP3Q6NUK4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms