Protein–RNA interactions for Protein: Q6BDI9

REP15, Rab15 effector protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REP15Q6BDI9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REP15Q6BDI9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
REP15Q6BDI9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REP15Q6BDI9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms