Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
CARMIL1Q5VZK9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
CARMIL1Q5VZK9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CARMIL1Q5VZK9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
CARMIL1Q5VZK9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
CARMIL1Q5VZK9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms