Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUG0

SFMBT2, Scm-like with four MBT domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT2Q5VUG0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SFMBT2Q5VUG0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SFMBT2Q5VUG0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SFMBT2Q5VUG0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SFMBT2Q5VUG0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms