Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC181Q5TID7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC181Q5TID7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC181Q5TID7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms