Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SAMD5Q5TGI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SAMD5Q5TGI4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms