Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRIF1Q5T3J3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRIF1Q5T3J3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRIF1Q5T3J3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRIF1Q5T3J3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms