Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HP1BP3Q5SSJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HP1BP3Q5SSJ5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HP1BP3Q5SSJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms