Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF260Q3ZCT1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF260Q3ZCT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF260Q3ZCT1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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