Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTLL9Q3SXZ7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTLL9Q3SXZ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TTLL9Q3SXZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTLL9Q3SXZ7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms