Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PDCD1Q15116 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDCD1Q15116 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCD1Q15116 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms