Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCAPHQ15003 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPHQ15003 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPHQ15003 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
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