Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCINQ13939 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCINQ13939 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCINQ13939 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCINQ13939 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCINQ13939 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCINQ13939 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCINQ13939 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCINQ13939 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCINQ13939 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCINQ13939 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCINQ13939 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCINQ13939 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCINQ13939 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCINQ13939 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCINQ13939 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCINQ13939 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCINQ13939 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCINQ13939 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCINQ13939 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCINQ13939 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCINQ13939 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCINQ13939 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCINQ13939 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCINQ13939 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCINQ13939 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCINQ13939 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCINQ13939 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCINQ13939 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCINQ13939 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCINQ13939 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCINQ13939 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCINQ13939 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCINQ13939 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCINQ13939 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCINQ13939 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
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