Protein–RNA interactions for Protein: Q13480

GAB1, GRB2-associated-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB1Q13480 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GAB1Q13480 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GAB1Q13480 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAB1Q13480 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms