Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOP3AQ13472 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOP3AQ13472 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TOP3AQ13472 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
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