Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 PCD1YLR151C 1023 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 BLS1YLR408C 369 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 VPS68YOL129W 555 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 HRT1YOL133W 366 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YOR343CYOR343C 327 nt6.87□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 HFI1YPL254W 1467 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 POP1YNL221C 2628 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 NUP53YMR153W 1428 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 NUF2YOL069W 1356 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YDL026WYDL026W 312 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 RPC53YDL150W 1269 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 DST1YGL043W 930 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YGR168CYGR168C 1131 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 MPM1YJL066C 759 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 HAM1YJR069C 594 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YJR096WYJR096W 849 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 BUD20YLR074C 501 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 ADE1YAR015W 921 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 CDA1YLR307W 906 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 AOS1YPR180W 1044 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 PSP2YML017W 1782 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 DRS1YLL008W 2259 nt6.86□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 PAP1YKR002W 1707 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 UBC5YDR059C 447 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YEA4YEL004W 1029 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 TES1YJR019C 1050 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 ATG29YPL166W 642 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 RCK1YGL158W 1539 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 TRP5YGL026C 2124 nt6.85□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 CTK2YJL006C 972 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YLL047WYLL047W 384 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YLR366WYLR366W 306 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 YAP7YOL028C 738 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 THI80YOR143C 960 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 MCT1YOR221C 1083 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 NOG2YNR053C 1461 nt6.84□□□□□ -1.31
AVO1Q08236 CLN1YMR199W 1641 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 TAH18YPR048W 1872 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PEX7YDR142C 1128 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PIB1YDR313C 861 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 KRE28YDR532C 1158 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 HAC1YFL031W 717 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YGR127WYGR127W 939 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 THI4YGR144W 981 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 CPR2YHR057C 618 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 DAL2YIR029W 1032 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YML090WYML090W 387 nt6.83□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 MSS1YMR023C 1581 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 TPO1YLL028W 1761 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 RRP14YKL082C 1305 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PCL2YDL127W 927 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 SHR3YDL212W 633 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YER137CYER137C 447 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 GEP7YGL057C 864 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YNG2YHR090C 849 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 POP5YAL033W 522 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YLL059CYLL059C 507 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PSY3YLR376C 729 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 VPS20YMR077C 666 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 CPT1YNL130C 1182 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PNS1YOR161C 1620 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PXL1YKR090W 2121 nt6.82□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 AVL9YLR114C 2295 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 MSS116YDR194C 1995 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 CKB1YGL019W 837 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YJL043WYJL043W 774 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 SUI2YJR007W 915 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YBR292CYBR292C 372 nt6.81□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 MET13YGL125W 1803 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 IRS4YKR019C 1848 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 NSE3YDR288W 912 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YFT2YDR319C 825 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 ERG26YGL001C 1050 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 COG7YGL005C 840 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YHR033WYHR033W 1272 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YHR112CYHR112C 1137 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YJR084WYJR084W 1272 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PSR1YLL010C 1284 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 SFT2YBL102W 648 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YOL162WYOL162W 648 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 IRC11YOR013W 471 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YSA1YBR111C 696 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 ALT2YDR111C 1524 nt6.8□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YDR514CYDR514C 1452 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PPZ2YDR436W 2133 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 PRP9YDL030W 1593 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 EFT2YDR385W 2529 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 EFT1YOR133W 2529 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 STE3YKL178C 1413 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 MED4YOR174W 855 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 RRP15YPR143W 753 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 IES1YFL013C 2079 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 ATG18YFR021W 1503 nt6.79□□□□□ -1.32
AVO1Q08236 YFL052WYFL052W 1398 nt6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 32.6 ms