Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
IRX6P78412 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
IRX6P78412 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
IRX6P78412 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRX6P78412 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRX6P78412 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRX6P78412 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
IRX6P78412 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
IRX6P78412 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
IRX6P78412 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
IRX6P78412 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
IRX6P78412 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IRX6P78412 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
IRX6P78412 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRX6P78412 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRX6P78412 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRX6P78412 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRX6P78412 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
IRX6P78412 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
IRX6P78412 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
IRX6P78412 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
IRX6P78412 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
IRX6P78412 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
IRX6P78412 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRX6P78412 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRX6P78412 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRX6P78412 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRX6P78412 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
IRX6P78412 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IRX6P78412 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
IRX6P78412 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
IRX6P78412 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
IRX6P78412 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
IRX6P78412 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
IRX6P78412 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
IRX6P78412 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
IRX6P78412 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IRX6P78412 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRX6P78412 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRX6P78412 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRX6P78412 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRX6P78412 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
IRX6P78412 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRX6P78412 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRX6P78412 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRX6P78412 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRX6P78412 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
IRX6P78412 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
IRX6P78412 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
IRX6P78412 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRX6P78412 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRX6P78412 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRX6P78412 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IRX6P78412 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IRX6P78412 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
IRX6P78412 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
IRX6P78412 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IRX6P78412 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IRX6P78412 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IRX6P78412 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
IRX6P78412 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
IRX6P78412 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms