Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VBP1P61758 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VBP1P61758 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VBP1P61758 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VBP1P61758 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VBP1P61758 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VBP1P61758 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VBP1P61758 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VBP1P61758 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VBP1P61758 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VBP1P61758 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VBP1P61758 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VBP1P61758 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VBP1P61758 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VBP1P61758 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VBP1P61758 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VBP1P61758 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VBP1P61758 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VBP1P61758 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VBP1P61758 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VBP1P61758 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VBP1P61758 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VBP1P61758 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VBP1P61758 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VBP1P61758 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
VBP1P61758 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VBP1P61758 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VBP1P61758 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VBP1P61758 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms