Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB25P57735 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB25P57735 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB25P57735 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB25P57735 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB25P57735 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB25P57735 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB25P57735 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB25P57735 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB25P57735 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB25P57735 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB25P57735 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB25P57735 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB25P57735 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RAB25P57735 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAB25P57735 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAB25P57735 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RAB25P57735 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms