Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IST1P53990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IST1P53990 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IST1P53990 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IST1P53990 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IST1P53990 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IST1P53990 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IST1P53990 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IST1P53990 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IST1P53990 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IST1P53990 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IST1P53990 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IST1P53990 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IST1P53990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IST1P53990 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IST1P53990 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IST1P53990 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IST1P53990 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IST1P53990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IST1P53990 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IST1P53990 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IST1P53990 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IST1P53990 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IST1P53990 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IST1P53990 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IST1P53990 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IST1P53990 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IST1P53990 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
IST1P53990 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IST1P53990 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IST1P53990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IST1P53990 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IST1P53990 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.2 ms