Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARFIP1P53367 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARFIP1P53367 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFIP1P53367 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARFIP1P53367 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms