Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2A1P52655 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2A1P52655 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF2A1P52655 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms