Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSK3BP49841 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GSK3BP49841 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GSK3BP49841 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms