Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTGFRP43088 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PTGFRP43088 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PTGFRP43088 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms