Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 SUB2YDL084W 1341 nt5.4□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YGL102CYGL102C 429 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 TIF2YJL138C 1188 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YJL211CYJL211C 444 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 TIF1YKR059W 1188 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 TMA46YOR091W 1038 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 ERG10YPL028W 1197 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 CWC27YPL064C 906 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SMX3YPR182W 261 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YBR113WYBR113W 483 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 PPM2YOL141W 2088 nt5.39□□□□□ -1.55
AVT5P38176 VPS70YJR126C 2436 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 TFC6YDR362C 2019 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YOL036WYOL036W 2286 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SQT1YIR012W 1296 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 CYS3YAL012W 1185 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YLL056CYLL056C 897 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YLR123CYLR123C 330 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 MRPL19YNL185C 477 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YOR268CYOR268C 399 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 CPA1YOR303W 1236 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YPR123CYPR123C 435 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 VPS4YPR173C 1314 nt5.38□□□□□ -1.55
AVT5P38176 TNA1YGR260W 1605 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 KEX2YNL238W 2445 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YHR020WYHR020W 2067 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 FMP40YPL222W 2067 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 DMA1YHR115C 1251 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 PRI1YIR008C 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YBL070CYBL070C 321 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 FIT2YOR382W 462 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.37□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SSK22YCR073C 3996 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 EDE1YBL047C 4146 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YKL223WYKL223W 333 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YOX1YML027W 1158 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 BSC4YNL269W 396 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 DBP9YLR276C 1785 nt5.36□□□□□ -1.55
AVT5P38176 STE13YOR219C 2796 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YJL163CYJL163C 1668 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 ICP55YER078C 1536 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 ENP1YBR247C 1452 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 EEB1YPL095C 1371 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 NPL6YMR091C 1308 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 OXP1YKL215C 3861 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YDR401WYDR401W 564 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SWD1YAR003W 1281 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 HMT1YBR034C 1047 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SFB3YHR098C 2790 nt5.35□□□□□ -1.55
AVT5P38176 MPA43YNL249C 1629 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 ATF1YOR377W 1578 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 OPT1YJL212C 2400 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 MFG1YDL233W 1377 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 ATG36YJL185C 882 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 SML1YML058W 315 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 RPR1RPR1 369 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 PRE5YMR314W 705 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 YPR076WYPR076W 375 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 GAA1YLR088W 1845 nt5.34□□□□□ -1.55
AVT5P38176 PGM1YKL127W 1713 nt5.34□□□□□ -1.56
AVT5P38176 MSY1YPL097W 1479 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 NUP49YGL172W 1419 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 CWC21YDR482C 408 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 AIM46YHR199C 933 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 SRN2YLR119W 642 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 YLR312CYLR312C 1197 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 PCS60YBR222C 1632 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 CRZ1YNL027W 2037 nt5.33□□□□□ -1.56
AVT5P38176 MSC3YLR219W 2187 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 COX20YDR231C 618 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 HEM2YGL040C 1029 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 RPL7AYGL076C 735 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 MIA40YKL195W 1212 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 YML083CYML083C 1257 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 RPL7BYPL198W 735 nt5.32□□□□□ -1.56
AVT5P38176 STT3YGL022W 2157 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 HED1YDR014W-A 489 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 COA1YIL157C 594 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 NPA3YJR072C 1158 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 DFR1YOR236W 636 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 SEC62YPL094C 825 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 COQ1YBR003W 1422 nt5.31□□□□□ -1.56
AVT5P38176 COX10YPL172C 1389 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT5P38176 MRS1YIR021W 1092 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT5P38176 YOL046CYOL046C 675 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT5P38176 JIP4YDR475C 2631 nt5.3□□□□□ -1.56
AVT5P38176 ROG3YFR022W 2202 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 TEL2YGR099W 2067 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 PPH21YDL134C 1110 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 SCO2YBR024W 906 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 YFR006WYFR006W 1608 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 DUG1YFR044C 1446 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 CST6YIL036W 1764 nt5.29□□□□□ -1.56
AVT5P38176 HXT17YNR072W 1695 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 COX15YER141W 1461 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 AGX1YFL030W 1158 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 GSY2YLR258W 2118 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 RFC4YOL094C 972 nt5.28□□□□□ -1.56
AVT5P38176 ASR1YPR093C 867 nt5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.8 ms