Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SOX6P35712 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SOX6P35712 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SOX6P35712 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX6P35712 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SOX6P35712 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX6P35712 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SOX6P35712 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SOX6P35712 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SOX6P35712 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SOX6P35712 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX6P35712 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX6P35712 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX6P35712 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SOX6P35712 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX6P35712 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX6P35712 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX6P35712 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX6P35712 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SOX6P35712 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX6P35712 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX6P35712 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX6P35712 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX6P35712 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SOX6P35712 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX6P35712 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SOX6P35712 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX6P35712 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX6P35712 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX6P35712 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX6P35712 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SOX6P35712 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SOX6P35712 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX6P35712 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX6P35712 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX6P35712 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX6P35712 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms