Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC8A1P32418 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC8A1P32418 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC8A1P32418 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC8A1P32418 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms