Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRKACGP22612 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKACGP22612 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKACGP22612 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms