Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EPHA1P21709 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EPHA1P21709 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EPHA1P21709 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms