Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB3AP20336 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3AP20336 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAB3AP20336 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms