Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPCAMP16422 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPCAMP16422 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPCAMP16422 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPCAMP16422 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms